ImageVis3D

ImageVis3D är en ny volym rendering program som utvecklats av NIH / NCRR centrum för integrativ medicinsk Computing (CIBC). De viktigaste konstruktionsmålen ImageVis3D är: skalbarhet, enkelhet och interactivity.Simplicity uppnås med ett nytt användargränssnitt som ger en oöverträffad nivå av flexibilitet (som visas på bilderna).
Skalbarhet och interaktivitet för ImageVis3D innebära att både en bärbar dator samt på en high end grafik arbetsstation kan användaren interaktivt utforska terabyte stora datamängder. Slutligen öppen källkod natur samt strikt komponenten-för-komponentdesign tillåter utvecklarna inte bara förlänga ImageVis3D utan också återanvända delar av det, såsom rendering kärna. Denna rendering kärna till exempel planeras att ersätta volymrenderings delsystem i många tillämpningar vid SCI-institutet och med våra samarbetspartners.
ImageVis3D är en Open Source-projekt som huvudsakligen finansieras via SCI institutets NIH / NCRR CIBC Center och DOE VACET. Vänligen använd följande bekräftelse och skicka oss referenser till eventuella publikationer, presentationer, eller framgångsrika ansökningar om finansiering som utnyttjar ImageVis3D programvara eller medföljande datamängder.

OBS: ImageVis3D bör köras på praktiskt taget alla moderna PC eller Mac. Det kräver ett grafikkort som stöder OpenGL 2.0, eller version 1.4 med förlängningar stöder GLSL shaders. Såvitt vi vet, nästan alla grafikkort uppfyller detta krav. Med vissa äldre kort, kan du bli tvungen att använda "Slice baserade" renderaren (standard) i stället för den stråle gjutnings renderaren (som har bättre kvalitet).

Vad är nytt i den här versionen:.

• En geometri omvandlare lades för GeomView filer
• Buggar fasta inkluderade en Clearview krasch, klippning plana interaktioner, frågor loading metamorfa filer, och en data korruption bugg lastning vissa "breda" datatyper.

Vad är nytt i version 2.1.0:

• Denna version lägger till en ny exportör för bildfiler, stöd för & quot; taggen & quot; volymer (som inte bör utförda med en linjär interpolant), en funktion för att skriva klippta data, en ny importör för Amira interoperabilitet och anpassade uttryck för dialogen sammanfogningen.
• Det fixar konvertering av färgbilder på vissa plattformar, en bugg med att upptäcka & quot; Inveon & quot; filer, ett problem med dator tegel gräns storlekar och en krasch med vissa typer av data samtidigt använder 1D överföringsfunktionen editor.
• ImageVis3D nu korrekt respekterar & quot; max tegel storlek & quot; inställning på Mac-system.

Vad är nytt i version 2.0.1:.

• Belysningsparametrar som är standard förbättrades
• histogram som stöder 1D överföringsfunktionen redaktör var kantutjämnas, och det är nu lättare att se gränsen (min / max) värden i samma histogrammet.
• Mer intelligent kvantisering utförs när det finns "flagga" dataset som på något sätt hamnade som flyttal.
• Minnesåteranvänds om en enda datauppsättning öppnas flera gånger.
• normaler kan nu läsas från Ply-filer.
• Histogram vågparametrar sparas per-dataset.
• Klippet plant tillstånd kopieras vid kloning fönster.
• En bugg med lastöverföringsfunktionsbibliotek på Mac och Linux fastställdes.
• Visual Studio 2010 stöd sattes.

Vad är nytt i version 2.0.0:

• Nya funktioner:
• Lång kör behandlingar (t.ex. fånga rotationer) kan nu avbrytas.
• (Tillfälligt) tillåter LoadDataset vara "interaktivt" i skriptläge, vilket möjliggör konvertering av rådata i det här läget.
• Den maximala tegelstorlek som används är nu en konfigurerbar parameter i inställningarna. Detta leder oss ett steg närmare att stödja integrerade Intel chipset.
• & quot;. Inspelningsläge & quot ;, som aktiveras när du tar en rotation eller skript ImageVis3D, kommer nu alltid återge data med dess ursprungliga upplösning
• Sida upp / Sida ned kan användas för att flytta en bit 10% genom dataset. Använd mushjulet för finskaliga positionering.
• ImageVis3D kan nu kvantisera uppgifter ner till 8bit vid export till ImageVis3D Mobile. Detta kommer att behövas i kommande inkarnationer av mobila verktyg.
• Buggar som fastställs i den här versionen:
• En Mac-only krasch som kan inträffa när du stänger ett render fönster fastställdes.
• I stället för att krascha (!), Är användarna varnas när deras grafikkort saknar den nödvändiga 3D textur storlek, och frågade om de vill fortsätta på egen risk.
• En bugg fastställdes fyller vissa typer av inbäddade JPEG i DICOMs.
• Clip plan nu korrekt respekterar relativa låsning.
• De framsteg tittaren nu hålls aktuell samtidigt fånga en rotation.
• Mouse hjulrotationer normaliserades när iterera igenom utsikt slice, särskilt för att se till att & quot; Mighty Mouse & quot; Mac möss kommer inte rulla för fort.
• Interaktion med ImageVis3D Mobile lades till den manuella dokumentation.
• Återställ (& quot; r & quot;) nu korrekt återställer fönsterstorlekar i 2x2-läge
.
• ImageVis3D drar nu cirkulär styrning widget för alla styrpunkter i & quot; Basic & quot; Läge 2D överföringsfunktion redaktör, i stället för bara de första.
• Fixat en bugg i rotationsriktningen när du tar en MIP rotation för vissa synpunkter.
• En bugg fastställdes rendering iso-ytor när 2x2-läge.
• Spela in en & quot; sekvens ram & quot; i tidigare versioner kunde, under vissa omständigheter, bifoga ett felaktigt nummer. De semantik uppdaterades något att göra & quot; senast sparade bildnummer & quot; upptäckt mer robust.
• Kataloger som inte öppnar kommer inte att stängas; i sällsynta fall, använde detta för att orsaka krascher på Mac-system.
• ImageVis3D är nu mer förlåtande för fallet att konvertera flera olika filer samtidigt.
• Fix lastning / konvertering av osignerade 16bit data (tyst / oavsiktligt stympade till 12 bitar i 1.2.0).
• Använd rätt dataset skalfaktorerna vid export till IV3D Mobile.
• Konvertering av RGBA datamängder fastställdes genom att uppdatera beräkningen av storleken på en UVF datablock.
• Fraunhofer EZRT (& quot; REK & quot;) omvandlare uppdaterades för att avlägsna antaganden om maskinen och datafil endian
.
• Ändringar som bara är av intresse för utvecklare:
• & quot; Ladda upp & quot; knappen togs bort från felsökningsloggen UI. De anonyma felrapporter det producerade var aldrig nyttigt.
• Den version av Qt används uppgraderades till 4.6.0.
• Någon dokumentation lades till förvaret på hur man definierar din egen konverterare. Användarna kommer att behöva bygga ImageVis3D från källan till detta.
• Många Tuvok klasser var (äntligen) flyttade in i & quot; Tuvok & quot; namespace.
• Kända problem med den här versionen:
• "Stack" (& quot; stk & quot;), singel-fil TIFF volym, och Fraunhofer EZRT (& quot; REK & quot;). Filformat kan bara läsas, inte skrivit
• Den "Brick Of Values" (BOV) läsare stöder inte BOVs där uppgifterna är uppdelade i flera filer.
• RGBA är den enda typ av fler uppgifter stöds.
• NVIDIA GPU på både Linux och Mac exponera en drivrutin fråga som kan hänga systemet under längre tidsperioder. För att kringgå detta problem, rekommenderar vi att hålla sig med slice baserade volym renderaren på Mac och Linux för denna utgåva.
• Fullfärgs dataset inte visar en riktig histogram i överföringsfunktionen redaktörer.
• I alla lägen, men MIP, det så kallade Brännare "använder alltid den högsta upplösning uppgifter, oavsett andra inställningar.
• I & quot; Inaktivera LOD & quot; sättet MIP Record, är framstegen inte informationen ges. Framsteg görs; ett synligt-korrekt rendering krävs inte för att skapa en on-skivavbilden som är synligt korrekt.
• Clearview objektivet inte positionera sig inte ordentligt när skärmen är i lågupplöst läge för att nå snabbare rendering.
• På vissa system, vilket gör ett render fönster större inte i och för sig inte orsakar fönstret för att uppdatera sin rendering. En lösning är att dra fönstret eller öppna en meny tvingar en uppdatering.