CLC DNA Workbench

CLC DNA Workbench skapar en programvarumiljö som gör det möjligt för användare att göra ett stort antal avancerade DNA-sekvensanalys, i kombination med smidig datahantering och utmärkta grafiska visning och output alternativ.
CLC DNA Workbench finns tillgänglig på Windows, Mac OS X, och Linux-plattformar

Egenskaper .

• Bioinformatik har i Gene Workbench :
• Flexibel visning av cirkulära molekyler.
• Redaktör för grafiskt och algoritmiskt avancerade primer design
• Montering av DNA sekvensdata
• Molekylär kloning
• Automatisk SNP anteckning av sekvenser
• Sök och upptäckten av DNA-mönster
• Lokal komplexitet regionen analyser
• Omvänd översättning från protein till genen, baserat på översättningstabeller från ett antal arter
• Avancerat restriktionsenzymanalys och förvaltning
• punktdiagram baserade analyser
• Kort form av DNA statistik, inklusive ett antal egenskaper hos en viss molekyl
• NCBI sekvensdata sök
• Åtkomst till webb information från PubMed
• Andra bioinformatik funktioner:
• DNA, RNA och protein sekvens redaktör visar både linjära och cirkulära molekyler
• DNA, RNA och proteininpass redaktör
• Interaktiva logotyper längs båda DNA, RNA och protein anpassningar
• Batch bearbetning av analyser av flera sekvenser i ett arbete steg
• Motif sök
• Mönster upptäckt (okända mönster)
• Avancerat återinställning och fixa-punkt justeringsalternativ
• Sekvens logo grafer längs DNA, RNA och protein väglinjer
• Manuell anteckning av sekvenser
• Integrated PubMed sökningar
• Webbaserad sekvens sökning genom BLAST
• punktdiagram baserade analyser
• Lokal komplexitet regionen analyser och komplexitet tomter
• Gap fraktionsdiagram
• G / C innehållsanalys och diagram
• Projekt och datahantering:
• Fullständig integrering av datainmatning, datahantering, beräkningsresultat, och exportera data
• Detaljerad historia log
• Alla typer av filer kan sparas i lokala projekt, och lanserat från programmet
• Import och export av data i ett stort antal filformat
• Möjlighet att arbeta i flera aktiva arbetsytor i taget, gör samtidigt arbeta med flera projekt
• Import av spår datafiler och kvalitetsresultat från automatiserade DNA sequening maskiner med Standard Chromatogram Format, ABI format och PHD-format (Phred)
• Visning och rapportering:
• Avancerat BLAST visa
• Avancerade grafer visa
• Avancerat histogram visa
• Avancerat punktdiagram visa
• Sök egenskaper i sekvenser och inriktningar

Krav :

• 256 MB RAM krävs
• 512 MB RAM rekommenderas
• 1024 x 768 bildskärmen rekommenderas

Begränsningar :

• 4-veckors fullt fungerande demo