misopy

Software skärmdump:
misopy
Mjukvaruinformation:
Version: 0.4.9
Ladda upp dagen: 20 Feb 15
Utvecklare: Yarden Katz
Licens: Gratis
Popularitet: 7

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

MISO (Blandning av Isoformer) är en probabilistisk ram skriven i Python som kvantifierar uttrycket nivån & nbsp; av alternativt splitsade gener från RNA-Seq data och identifierar differentiellt reglerade isoformer eller exoner över prover.
Genom att modellera den genera process genom vilken läser framställs av isoformer i RNA-Seq använder MISO modell Bayes inferens att beräkna sannolikheten att en läsning härstammar från en viss isoform.
MISO använder härledas tilldelning av läser till isoformer att kvantifiera bestånd av den underliggande uppsättningen av alternativa mRNA-isoformer. Konfidensintervall över uppskattningar kan erhållas, vilket kvantifiera tillförlitlighet uppskattningar.
Se http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ för MISO manual och dokumentation

Krav :.

  • Python

Liknande mjukvara

AHREA
AHREA

11 May 15

RFLP planner
RFLP planner

3 Jun 15

Jmol
Jmol

22 Jun 18

Ghemical
Ghemical

3 Jun 15

Kommentarer till misopy

Kommentarer hittades inte
Kommentar
Slå på bilder!