Måste ha Bioinformatik För Linux

smörbult är en Python API för läsning av binära datafiler skapas med hjälp datahantering ramverket smörbulten next-gen.Normalt kommer denna katalog som en del av det kompletta smörbulten paketet, tillgänglig från:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Det...

. HTSeq är en Python ram för att bearbeta och analysera data från hög genomströmning sekvense (HTS) analyser Krav : < li>...

Jmol är en öppen källkod, plattform och gratis grafisk programvara som ursprungligen är utformad för att fungera som molekylärvisare för 3D-kemiska strukturer. Den körs i fyra fristående lägen, som en HTML5-webapp, ett Java-program, en Java-applet och en...

LSim överlagrar makromolekylära elektrontäthet och beräknar en strukturell likhet poäng. Sina beräkningar skala linjärt med storleken på molekylerna som jämförs.De LSim inriktningar är konceptuellt samband med biokemiska konstruktionselement och därför är...

MacMolPlt är ett modernt grafikprogram för att rita 3D-molekylära strukturer och normala lägen (vibrationer). Moderna...

MACS2 är en modell som bygger analysverktyg för spån Seq uppgifter.Med förbättrad sekvenseringstekniker, kromatin immunoprecipitation följt av hög genomströmning sekvense (chip-Seq) blir populär att studera genomet hela protein-DNA-interaktioner. För att...

massXpert massa paket spektrometri är en masspektrometri miljö för linjär (bio-) polymerer. Det ärver alla nyheterna i GNU polyxmass, eftersom det är en hamn i det aktuella projektet till en plattformsoberoende utvecklingsmiljö Vad är nytt i den här...

MetagenomeDB är en Python-bibliotek för att enkelt lagra, hämta och kommentera metagenomic sekvenser. & Nbsp; MetagenomeDB fungera som ett abstraktionslager ovanpå en MongoDB databas. Det ger ett API för att skapa och ändra och koppla två typer av objekt,...

MISO (Blandning av Isoformer) är en probabilistisk ram skriven i Python som kvantifierar uttrycket nivån & nbsp; av alternativt splitsade gener från RNA-Seq data och identifierar differentiellt reglerade isoformer eller exoner över prover.Genom att...

mpiBLAST är en MPI bygger genomförs parallellt NCBI BLAST. Projektet består av ett par program som ersätter formatdb och Blåställ med versioner som utför BLAST jobb parallellt på ett kluster av datorer med MPI installerade. Det finns två huvudsakliga...