Måste ha Bioinformatik För Linux

ProteinShop är ett interaktivt verktyg för att manipulera proteinstrukturer. Den var avsedd för att snabbt skapa en uppsättning av proteinkonfigurationer med mänsklig kunskap och intuition. Dessa konfigurationer kan utsättas för lokal eller global...

pyNetConv är en Python-bibliotek som skapats för att hjälpa omvandlingen av vissa nätverks filformat.Sedan version 0.6, är pyNetConv kapabel att läsa / skriva (och konvertera från / till) följande...

Pysam är en Python-modul för att läsa och manipulera Samfiles. & Nbsp; Det är en lätt täckblad av samtools C-API.Snabbstartsguiden är här. Mer detaljerad dokumentation finns här.Frågor och kommentarer är mycket välkomna och bör skickas till den pysam...

PySCeS är ett projekt som utvecklats av Triple-J-gruppen för Molecular Cell Physiology. & Nbsp; för att försöka modell och förstå de komplexa processer och system som utgör den levande cellen Funktioner :. En text baserad modell beskrivningsspråk ...

reciprocal_smallest_distance är en parvis orthology algoritm som använder global sekvensinpass och maximum likelihood evolutionära avståndet mellan sekvenser att exakt upptäcker ortologer mellan genomen. Installera från ett tarball Ladda ner och packa upp...

RFLP planerare är ett verktyg som hjälper till att planera en RFLP experiment: Den finner restriktionsenzymer som skär en uppsättning homologa DNA-sekvenser på olika sätt och simulerar den resulterande gel-elektroforesbild. Programmet hjälper dig att...

Seal är en Python-modul som ger sekvensinpass på Hadoop.Seal är en av MapReduce ansökan om biologisk sekvensinpass. Den körs på Hadoop (http://hadoop.apache.org) genom Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), ett Python MapReduce och HDFS API för Hadoop. ...

seriesoftubes är en utökad pipeline för Solexa Chip-seq uppgifter.Paket Dokumentation Krav : ...

Bygga system som gör används ofta för att skapa komplicerade arbetsflöden, t.ex. i bioinformatik. & nbsp; snakemake syftar till att minska komplexiteten i att skapa arbetsflöden genom att tillhandahålla en ren och modern domänspecifik specifikation språk...

SSuMMo är ett bibliotek med funktioner som utformats kring iterativt med hjälp hmmer att tilldela sekvenser till taxa. & Nbsp; Resultaten är mycket kommenterade träd som visade arter / genus fördelning inom denna gemenskap.Program som medföljer källkoden...