Ascalaph Designer

Ascalaph Designer är ett universalprogram för molekylära dynamiska simuleringar. Under en enda grafisk miljö representeras som sitt eget genomförande av molekyldynamik samt metoder för klassiska och kvantmekanik av populära program. Funktioner inkluderar molekylära grafik: flera fönster, två kameror per modell, CPK, Trådram, Stick, Ball och Stick och CPK Wire ram stilar, molekylär modell byggnad: kristall byggmästare, kedja byggmästare, dra med musen, molekylär geometri redigering, preliminär optimering , kvant optimering, och sammandrabbningar ta bort, molekylär geometri optimering med konjugat lutning metoder, molekyldynamik: många steg integrationstiden, fjärde ordningen integration, superdatorberäkningar med hjälp av MDynaMix, flexibel SPC vattenmodell, och implicit vattenmodell, och kvantkemi med hjälp av CP2K och PC GAMESS / Firefly:. energi, molekylär geometri optimering och potential härrör avgifter