Bio-Linux

Bio-Linux är ett operativsystem med öppen källkod baserad på världs & rsquoen; s mest populära gratis utdelning av Linux, Ubuntu, byggd kring den moderna Unity skrivbordsmiljön, och utformats från grunden för att kunna användas av bioinformaticians.Distributed som singel, dubbel-båge Live DVDThe distro kan laddas ner från Softoware som en enda, dubbla arch Live DVD ISO-bilder på cirka 3GB i storlek, stöder både 64-bitars (x86_64) och 32-bitars (i386) instruktionsuppsättning arkitekturer. Det måste sättas till antingen en USB-flash-enhet eller DVD-skiva för att kunna starta den från BIOS på en computer.Boot optionsBeing baserad på Ubuntu och har en identisk thanterare, utformad så att du kan prova operativsystemet utan att installera något direkt starta installationsprogrammet, testa RAM för fel, starta från den första skivan, samt att kontrollera integriteten för den startbara mediet (endast om du använder en DVD-media) .Modern och produktiv skrivbordsmiljö drivs av UnityAs nämnts, distribution & rsquoen ; s standard och endast skrivbordsmiljö är Unity, som använder en panel / docka layout. Medan panelen, som ligger på den övre delen av skärmen, är perfekt för att interagera med program som körs, kommer dockan att hjälpa dig att snabbt starta din favorit applications.Some av de bästa öppen källkod bioinformatik appsSome av de bästa öppen källkod bioinformatik applikationer ingår i denna Ubuntu-baserade operativsystem, bland vilka kan nämnas lagen, Arb, Cn3D, cytoscape, Archaeopteryx, Artemis, BTmapqtl, clustalx, Dendroscope, DDV Sequence Alignment Viewer, Entrez, Eqtl, Galaxy, GAP4, GAP5, FastQC, Geneious, ggobi, ISACreator, kung, LRmapqtl, mesquite och Jemboss.Bottom lineSumming upp, är Bio-Linux en riktigt snabb och produktiv operativsystem baserat på den senaste uppströms Ubuntu-version och använda GNOME Classic skrivbordsmiljön, liksom några av de bästa öppen källkod bioinformatik applikationer

Vad är nytt i den här versionen:.

• Åtgärdar ett färskt nummer med skrivbordet misslyckas med att starta på VirtualBox på grund av inkompatibla drivrutiner.
• Uppdateringar olika paket, särskilt QIIME och Bowtie-Bio verktyg.
• Lägger till pandaseq parade slutet assembler.
• Lägger de uppdaterade nybörjare handledning specifika för Bio-Linux 8.

Vad är nytt i version 8.0.2:

• Ny Ubuntu 14.04 bassystem stöder den senaste hårdvaran och ger upp-to-date kontorsprogram, multimedia, etc.
• Uppdaterade versioner av nyckel bioinformatik applikationer som QIIME, Mothur, Jalview, Artemis, BLAST, Bowtie-Bio verktyg och många fler (användare som inte uppgraderar kommer inte längre få uppdateringar).
• Up-to-date versioner av många R paket, inklusive ggplot2, DESeq och kantverk plus uppdaterade bioledare och tusentals fler paket tillgängliga för direkt installation via C2D4U.
• Tillhandahållande av förberedda mallar för användning på VMWare / VirtualBox.
• Byte av NX med x2go, en mer flexibel version av den snabba och säkra fjärrskrivbordssystem.
• Införande av MATE skrivbordet som en lätt alternativ till Unity.
• En mer robust förpackning av Galaxy, med stöd för lastning verktygs skjul verktyg, Apache proxy, automatiserad PostgreSQL set-up, autentisering till lokala konton och SFTP filöverföringar.
• En gratis kattunge med varje nedladdning!
• ... ok, jag kanske har ljugit om kattungen men vi har några underbara nya tapeter som lämnats in av användarna - se nedan
.

Vad är nytt i version 7.0.3:

• Bio-Linux 7 är en fullt utrustad, kraftfull , konfigurerbar och lätt att underhålla bioinformatik arbetsstation. Bio-Linux ger mer än 500 bioinformatik program på en Ubuntu Linux 12.04 LTS bas. Det är en grafisk meny för bioinformatik program samt enkel tillgång till Bio-Linux bioinformatik dokumentationssystem och provdata användbara för testprogram.
• Bio-Linux 7 lägger till många förbättringar jämfört med tidigare versioner, inklusive Galaxy analysmiljö. Det finns också olika paket för att hantera nya generationens sekvensdatatyper.
• Du kan installera Bio-Linux på din maskin, antingen som enda operativsystem, eller som en del av en dual-boot installation som gör att du kan använda din nuvarande system och Bio-Linux på samma hårdvara.
• Bio-Linux driver även Live från DVD eller ett USB-minne. Detta körs i minnet på din maskin och inte innebär installera någonting. Detta är en stor, inget krångel sätt att prova Bio-Linux, demonstrera eller undervisa med det, eller att jobba med när du är på resande fot.
• Bio-Linux bygger på öppen källkod system och programvara, och så är fri att installera och använda.