GENESIS (kort för General Neural Simulation System) är en generell simuleringsplattform som utvecklats för att stödja simulering av neurala system som sträcker sig från subcellulära komponenter och biokemiska reaktioner på komplexa modeller av enskilda nervceller, simuleringar av stora nätverk, och system- level modeller.
GENESIS har legat till grund för laboratoriekurser i neurala simulering vid Caltech, marinbiologiska laboratorium, Kreta, Trieste, Bangalore och Obidos korta kurser i beräknings neurovetenskap, och åtminstone 49 universitet som vi är medvetna om.
De flesta av dagens GENESIS applikationer innebär realistiska simuleringar av biologiska neurala system. Även programvaran kan också modellera mer abstrakta nätverk, andra simulatorer är mer lämpade för backpropagation och liknande konnektionistiska modellering.
Installation
1. Välj den plats där du vill installera "genesis" katalogträd. Om du gör en systemomfattande installation som "root" användare, / usr / local är ett bra val. För en personlig installation, utan rootbehörighet, kan du använda din hemkatalog ("~"). Byt till den här katalogen och packa uppkomst katalog från arkivfilen genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. Till exempel,
cd / usr / local
tar xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
eller var du än har det (t.ex. ~ / downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz).
2. Byt till "genesis" katalog och kör installations skript som skapar ".simrc" GENESIS initieringsfil ". Kopiera sedan .simrc till din hemkatalog.
cd genesis
./binsetup
cp .simrc ~
3. Finallly, lägga till uppkomst katalogen till din sökväg, så att "genesis" kan hittas från någon katalog som du befinner dig i. Om din inloggningsskal är bash, kan du göra det genom att redigera .bashrc filen i din hemkatalog att lägga till raden
PATH = $ PATH: / usr / local / genesis
vid slutet av filen. Om du använder tcsh eller csh som ditt kommandoskal, lägg
set path = ($ path / usr / local / genesis)
till .tcsh eller .csh fil.
Vid denna punkt, är du redo att försöka köra GENESIS. Byt till katalogen genesis / skript och prova några av de tutorials som föreslås i README-filen
Vad är nytt i den här versionen.
- Många buggfixar och förbättringar.
Kommentarer hittades inte