KaKs Calculator

Kåks Calculator är ett programpaket som beräknar nonsynonymous och synonyma substitutionshastigheter genom modellval och modell genomsnitt. Eftersom befintliga metoder för skattning anta sina specifika mutation modeller som beaktar olika evolutionära egenskaper, vilket leder till olika uppskattningar, Kåks Calculator genomför en uppsättning kandidat modeller i en maximal ram sannolikhet och antar Akaike informations kriteriet för att mäta kondition mellan modeller och data, som syftar att inkludera så många funktioner som behövs för att korrekt fånga evolutionära information proteinkodande sekvenser. Dessutom är flera befintliga metoder för att beräkna Ka och Ks också införlivas detta program.