MultiDendrograms

MultiDendrograms är ett enkelt men kraftfullt program för att göra hierarkiska Kluster av verkliga data, distribueras under en öppen källkodslicens. & Nbsp; Från en avstånd (eller vikter) matris, MultiDendrograms beräknar sin dendrogram använder de vanligaste agglomerativ Hierarkisk Clustering algoritmer tillåter inställning av många av de grafiska representation parametrar och resultaten kan enkelt exporteras till fil. En sammanfattning av egenskaper:
- Multi: utvecklat i Java, körs i alla operativsystem (t.ex. Windows, Linux och MacOS).
- Grafiskt användargränssnitt: dataurval, hierarkiska klusteralternativ dendrogram representations parametrar, navigering över dendrogram, avvikelse åtgärder.
- Hierarkiska Clustering algoritmer implementerade: variabel grupp Single Lyft, Komplett Lyft, ovägt genomsnitt, vägt genomsnitt, Oviktat centroida, Weighted centroida och gemensamma mellan-i.
- Representation parametrar: storlek, orientering, etiketter, axel, etc.
- Avvikelse åtgärder: Cophenetic korrelationskoefficient, normaliserade Mean Squared Error och normaliserad medelabsolutfel.
- Export: ultrametric matris, dendrogram detaljer i text och Newick trädformat.
- Tomt: dendrogram bild i JPG, PNG och EPS format.
MultiDendrograms implementerar variabel gruppen algoritmer för att lösa icke-unika problem som finns i de vanliga par-grupp algoritmer och implementeringar. Detta problem uppstår när två eller flera minimiavstånd mellan olika kluster är lika under sammanslutningen processen. Den standardmetod består i att välja ett par, bryta banden mellan avstånd, och fortsätter på samma sätt tills den slutliga hierarkisk klassificering erhålls. Men olika clusterings är möjliga beroende på det kriterium som används för att bryta banden (vanligen ett par bara valts ut slumpvis!).
Den rörliga koncern algoritmer gruppen mer än två kluster samtidigt när banden uppträder, gett upphov till en grafisk representation kallas multidendrogram. Deras främsta egenskaper är:
- När det inte finns några band, de variabla gruppalgoritmer ger samma resultat som de par-grupp kära.
- De ger alltid en entydigt bestämd lösning.
- I multidendrogram representation för de resultat man kan tydligt observera förekomsten av banden under agglomerationstillståndet processen. Dessutom höjden av varje fusionsintervallet (banden i programmet) anger graden av heterogenitet inne i motsvarande kluster

Krav .

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment