QMForge projektet kan användas för att analysera resultaten av kvantkemi (DFT) beräkningar. Gauss 98/03, ADF, GAMESS (US), GAMESS (UK), PC-GAMESS, Jaguar och ORCA filer stöds (se nedan). Nedanstående analyser finns:
· Mulliken Population Analysis (MPA)
· C-kvadrat Population Analysis (SCPA)
· Överlappning Population Analysis (OPA)
· Mayers Bond beställningar
· Ladda Upplösningen Analys (CDA)
· Fragmentanalys
MPA, CSpA och OPA kräver en användardefinierad uppsättning av fragment, och skriver ut procentuella bidrag dessa fragment gör mot varandra molekylorbitalteori i molekylen. Mayers obligations order beräknar obligations order mellan varje par av atomer i molekylen. CDA och fragmentanalys kräver tre eller fler beräkningar (en för hela molekylen och två fragment beräkningar), och ge information om bindnings interaktioner mellan fragment.
QMForge är direkt ättling till PyMOlyze, som var inspirerad av konsolbaserat, (ursprungligen) Windows-program AOMix som har funktioner, inklusive (och utöver) de som anges ovan. Jag ursprungligen skrev PyMOlyze eftersom jag ville ha en användarvänlig (dvs.. Grafisk) Linux program för att göra MPA för varje molekylorbitalteori av gaussiska beräkningar. I förlängas det för att hantera filer från geometri optimeringar eftersom jag fann mig själv önskar jag kunde översätta och rotera optimerad struktur och spara den som en XYZ-fil. Nu har det döpts QMForge, och jag använder den för nästan allt utom att molekylorbitalteori bilder och diagram.
Det finns fortfarande några analyser som QMForge inte gör, så om det inte tar upp dina behov, ta AOMix (eller skjuta mig ett mail och vi kommer att prata).
QMForge har skapats med hjälp av Python skriptspråk, den Qt4 toolkit och dess python förlängningar PyQt4, numeriska och cclib compuational paketet tolkning bibliotek. Det har testats på Windows XP, Windows 2000 och Mac OS X; det borde fungera lika bra på alla GNU / Linux-distribution, även om jag inte har testat det ännu.
Vad är nytt i den här versionen:
· Namnbyte till QMForge
· ORCA stöd
· Växla till numpy 1.0.2 och openbabel 2.1.1
· Använder cclib byggs från 0,8 gren + unreleased ORCA parser
Kommentarer hittades inte