QuasiRecomb

Software skärmdump:
QuasiRecomb
Mjukvaruinformation:
Version: 1.0
Ladda upp dagen: 22 Jan 15
Utvecklare: Armin Topfer
Licens: Gratis
Popularitet: 12
Storlek: 3757 Kb

Rating: 3.0/5 (Total Votes: 1)

QuasiRecomb är ett lätt program som körs i kommandokonsolen, simulerar en Markov-modellen för att generera virus kvasispecies. Den beskriver generering av de virala kvasispecies och en metod för att sluta sina parametrar genom att analysera nästa generations sekvenseringsdata. Modellen är validerad på simulerade data, som visar fördelen med explicit ta rekombination processen beaktas, och testas genom att man på läsningar erhållits från experimentella HIV prover. Den erbjuder en implementering av EM-algoritmen för att hitta maximal en efterhands uppskattningar av modellparametrar och en metod för att uppskatta fördelningen av virusstammar i kvasispecies

Krav :.

Java

Stödda operativsystem

Liknande mjukvara

WinStars
WinStars

7 May 15

pHMeter
pHMeter

21 Jan 15

OligoChecker
OligoChecker

25 Oct 15

Annan programvara för utvecklare Armin Topfer

InDelFixer
InDelFixer

22 Jan 15

Kommentarer till QuasiRecomb

Kommentarer hittades inte
Kommentar
Slå på bilder!