SIGINT-projektet är ett kommando-line verktyg som kan användas för att hitta och rangordna däggdjursproteiner / gener som specifikt och väsentligt interagerar med en lista av proteiner / gener i samband med en bakgrund däggdjurs signalome och interactome nätverk.
Ingångarna till programmet är: (a) ett frö förteckning över de mänskliga Entrez Gene gen symboler, (b) en bakgrund nätverk i SIG-format, och (c) ett namn för utdatafilen (webbsida filnamn med htm förlängning ). SIGINT utmatar en sorterad lista av gener / proteiner som interagerar med komponenter från listan utsäde. Dessa komponenter är sorterade efter ett z-poäng som mäter specificiteten av dessa mellanliggande komponenter för att interagera med de gener / proteiner i listan utsäde.
SIGINT kan köras på Linux, Mac och Windows operativsystem och det kräver en bakgrund nätverk textfil i SIG-format.
Användning:
Packa upp arkivet
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
Kommentarer hittades inte