proTRAC

proTRAC är ett unikt och praktiskt verktyg för probabilistiska Pirna kluster upptäckt, visualisering och analys. proTRAC visar högre känslighet och selektivitet jämfört med hittills tillämpade metoder för kluster upptäckt. Betydelsen av den observerade sekvensen läst hit täthet, sträng partiskhet, mängd loci motsvarar sällan mappade sekvens läser, mängden loci med T vid position 1 eller A i position 10 och mängden loci inom typiska Pirna längdintervall (26- 32nt) beaktas. De observerade egenskaper klusterkandidater utvärderas mot bakgrund av den givna dataset och är föremål för en probabilistisk poängsystem.