Visnings protein-protein och ligand-proteininteraktioner som grafer (nätverk), där biomolekyler representeras som noder och deras interaktioner företräddes av länkar, är en lovande strategi för att integrera experimentella resultat från olika källor för att uppnå systematisk förståelse av molekylära mekanismer körning cellfenotyp. Framväxten av storskaliga signaleringsnätverk ger en möjlighet för topologiska statistisk analys, medan visualisering av dessa nät utgör en utmaning. SAVI genomför standardmetoder för att beräkna klustring, distribution anslutning och upptäckt, samt visualisering av nätverks motiv. Dessutom, SAVI genererar en komplett webbplats från nätverksdatamängder i textformat. SAVI innehåller ett verktyg som heter PathwayGenerator. Detta verktyg skapar anslutningskartor som webbsidor från stora tabeller beskriver cellsignalering interaktioner. SAVI kan också skapa nätverk från listor över genen / protein namn
Version 2.5 kan innefatta ospecificerade uppdateringar, förbättringar eller buggfixar
Krav ..
Windows (alla)
Kommentarer hittades inte