InterMine

InterMine ger rutiner för tillträde till datawarehouses drivs av InterMine teknik.
InterMine är en kraftfull öppen källkod datalager systemet. Använda InterMine kan du skapa databaser av biologiska data nås av avancerade webbfrågeverktyg. Tolkar finns för att integrera data från flera vanliga biologiska format och det finns ett ramverk för att lägga till egna uppgifter. InterMine inkluderar en attraktiv, användarvänligt webbgränssnitt som fungerar "out of the box" och kan enkelt anpassas för dina specifika behov.
Allt InterMine koden är fritt tillgänglig under LGPL licensen

Vad är nytt i den här versionen:.

• Länka in till InterMine:
• Det finns flera nya sätt att länka in i din Mine. Se Länkar för mer information.
• webbtjänst JSON format:
• Det finns flera nya Webservice resultat format. Joining jsonobjects som dök upp i 0,95, nu har vi JSON format för ganska mycket allt annat:
• Resultat:
• jsonrows - tabell representation av data med extra metadata
• & quot; jsontable & quot; . - Containerformat för att bygga inbäddade mallar (se: imbedding handledning)
• & quot; count & quot; och & quot; jsoncount & quot; - Format för bara emot räkningen av en fråga
• WebService metadata (Modell och mallar):
• & quot; json & quot; - Lätt parsable versioner av datamodellen och tillgängliga mall lista
• Autentisering Nu Arbeta i Perl Webservice Kund:
• Användare av Perl Webservice klienten har nu program tillgång till sina listor och privata mallar. Helt enkelt ge dina inloggningsuppgifter till kunden för att komma åt ditt konto (dina uppgifter överförs i krypterat format). Denna funktion kommer att arbeta med alla gruvor med webservices, inte bara de på 0,96 och uppåt.
• Objekt Resultat med Webservice Kunder:
• Perl och Java-klienter har möjlighet att få tillbaka resultaten som objekt (JSON objekt, eller i Perl, uppblåsta upp till full resultatobjekt). Detta förenklar vissa komplexa frågor databehandling, och hantera yttre kopplingar och samlingar.
• Inbäddade Tabeller:
• kan nu bädda Du inbyggt datatabeller från någon gruva med en stödjande Webservice i dina webbsidor med JavaScript och CSS. Se imbedding handledning för en demonstration och en introduktion till denna teknik. Var noga med att leka med den nya JavaScript-biblioteket finns på http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registry:
• Vi har lanserat en central registreringstjänst för InterMine implementeringar. Detta kommer inte bara fungera som en & quot; Gula-sidor & quot ;, som möjliggör besökare att upptäcka nya datakällor, och underlätta driftskompatibilitet mellan gruvorna själva, men det stöder också de webservices genom att tillhandahålla ett register över Webservice webbadresser och versioner. Besök registret på http://www.intermine.org/registry, och för att få hjälp att registrera din egen gruva, besök RegisteringYourMine.
• Länk Redirects:
• Du kan lägga till en semesterbostad ha länkar i resultaten sidor omdirigerar till en webbadress. Se LinkRedirects för mer information.
• Hemsida innehåll:
• Hemsidan för InterMine kan nu konfigureras för att visa olika information baseras på huruvida användaren är ny. Se HomepageConfig för instruktioner om hur du konfigurerar detta beteende.
• Ny etikett:
• Vi har lagt till en ny tagg: im: admin. Om du taggar en mall med im: admin, kommer det inte att dyka upp i ditt webapp. Detta är användbart för att dölja mallar som behövs av InterMine s webservices från dina användare. Se Tagga för en lista över alla tillgängliga taggar.
• Lista uppladdning:
• Listan uppladdningsprocessen har förbättrats.
• Andra förändringar:
• UPDATE - strängare multipel hypotesprövning korrigering på anriknings widgets. & Quot; Antal tester & quot; är nu antalet termer i samband med referenslistan.
• UPDATE - mer hjälpfilteralternativ på anriknings widgets
• NYTT - Holm-Bonferroni alternativet läggs till anriknings widgets
• UPDATE - nya & quot; bort & quot; knappen på listor sida
• UPDATE - interaktioner displayer laddad via AJAX så rapporterar sidan laddas snabbare
• FIX - & quot; poäng & quot; bilder som visar korrekt på sökresultat
• UPDATE - QueryBuilder mer interaktiv, välja ett objekt i listan tar dig tillbaka till den ursprungliga posten efter sida refresh / reload
• UPDATE - länk läggs till kolumn sammanfattning på frågeresultat, gör enklare att visa tydliga värderingar
• FIX - inloggnings bugg om blandade fall användarnamn
• FIX - widget bugg när du tittar efter exporten widget uppgifter
• NYTT - mall frågor är sorterade på popularitet, såvida du inte är inloggad, i vilket fall de beställs senast det datum varje fråga senast kördes
• FIX - uppgifter upprepas inte i & quot; diverse & quot; avsnittet rapportblad
• FIX - mallar visas korrekt på rapportsidan även för underklasser
• FIX - mallar korrekt rendering på aspekt sidor
• UPDATE - uppdaterad BioGRID omvandlare för att hantera förändringar i nyaste datafiler
• FIX - olika & quot; guld & quot; Temat CSS och bilder förbättras och uppdateras
• FIX - tråden säkerhetsfråga upp i mallen spårning
• UPDATE - bords widgets kan gruppera med ett attribut samt en klass

Krav :

• Python