LSim

LSim överlagrar makromolekylära elektrontäthet och beräknar en strukturell likhet poäng. Sina beräkningar skala linjärt med storleken på molekylerna som jämförs.
De LSim inriktningar är konceptuellt samband med biokemiska konstruktionselement och därför är opartisk och lämpliga för struktur enbart protein likhets studier.
Installation:
Packa upp distributions fil:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Flytta till filkatalogen:
cd lsim.1.0.0
Kopiera är tillgängligt via PATH-miljö variabel, till exempel flytta eller länka den körbara filen lsim till en lämplig plats -och se till att lsim:
cp lsim / usr / local / bin
Sätt variabel LSIMDIR att den pekar på den valda LSim katalogen, t ex:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0