Command line verktyg för att jämföra kommaseparerad datafiler med hjälp relativa skillnaderna för att fastställa de mest liknande konformationer. Compsortall jämför datafiler med hjälp relativa skillnaden, beräknar en likhet poäng, sorterar poängen ur kärnan i stigande ordning (lägre värden representerar större likhet), sparar alla poäng i en textfil. De datafiler som produceras av användaren, måste kommaseparerad textfiler. Varje fil representerar en unik molekyl. Varje rad i en fil representerar en unik konformation av molekylen. Den första kolumnen i datafilen måste vara en etikett unikt för konforma representeras av raden. Resten av kolumnerna är numeriska beskrivningar, såsom avståndsmätningar utrymme. Raderna jämförs kombinatoriskt mellan filer. Etiketterna i jämförelse är sammanlänkade och sparas med poängen för uppsättning rader. Detta tillhandahåller ett sätt att identifiera de konformationer som producerade en given likhetspoäng.
Framtida arbete omfattar:
lägga GUI gränssnitt
utstationering papper på min 3D farmakofor modellering algoritm
En parallell version med MPI
Vad är nytt i den här versionen:
- Ändrad skärmutgång för sista sammanslagning och skriva cykeln till mer korrekt återspeglar antalet linjer samman och skrivit.
- Fast stavfel.
- Små förändringar i källkoden kommentera och variabelnamn för att förbättra läsbarheten
Krav :.
Mac OS X 10.3
Kommentarer hittades inte