InDelFixer

InDelFixer är java-program för att ta bort bildförskjutning orsakar insättningar eller strykningar från nästa generations sekvenseringsdata. I vissa fall är det känt att proteinet av intresse inte har några varianter med ram skift. Dessa ram skift kan korrigeras med en given referens genomet (eller multipel anpassning i en framtida version). Programmet accepterar standardflödes gram formaterade filer, FASTA / PacBio CCS-filer, och Illumina parade data end som FASTQ filer

Krav :.

Java 7