MACS2 är en modell som bygger analysverktyg för spån Seq uppgifter.
Med förbättrad sekvenseringstekniker, kromatin immunoprecipitation följt av hög genomströmning sekvense (chip-Seq) blir populär att studera genomet hela protein-DNA-interaktioner. För att åtgärda bristen på kraftfulla Chip-Seq analysmetod, presenterar vi en ny algoritm, som heter Modellbaserad analys av Chip-Seq (MACS), för att identifiera avskrift faktorbindningsställen. MACS fångar påverkan av genomet komplexitet att utvärdera betydelsen av berikade CHIP regioner, och MACS förbättrar den rumsliga upplösningen i bindningsställen genom att kombinera information av både sekvense tag position och orientering. . MACS lätt kan användas för spån-Seq uppgifter ensam eller med kontrollprov med ökningen av specificitet
Krav :
- Python
Kommentarer hittades inte