BioPerl

BioPerl utvecklades för att behandla biologiska uppgifter i Perl.
Det är ett verktyg för att utforska Perl möjligheter i bioinformatik världen

Vad är nytt i den här versionen:.

• Major Windows supportuppdateringar
• MAKER uppdatering för att möjliggöra strängare standard kodon tabellen
• Bättre stöd för cirkulära sekvenser
• Fixar för vissa komplexa platstyper
• Address contig bugg i GenBank-format
• Deobfuscator fixar

Vad är nytt i version 1.6.922:.

• Adress CPAN prov misslyckanden
• Lade BIOPROJECT stöd för Genbank filer.
• Bättre regex stöd för HMMER3 utgång.

Vad är nytt i version 1.6.901:

• Användning av AcePerl är föråldrat; Ace.pm inte aktivt underhålls, och moduler som använder Ace kommer också att föråldras.
• Mindre buggfix release.
• Bio :: SeqIO :: gbXML tester kräver XML :: SAX.
• Adress Build.PL frågor när DBI inte är närvarande.
• Hoppa gbxml.t och Interpro testar när modulerna inte installerat.
• Ta bort Deprecated kod för perl 5.14.0 compat.
• På grund av schemaändringar och brist på stöd för äldre versioner, är stödet för NeXML 0.9 endast (mycket) delvis genomfört.