Ny Bioinformatik För Linux

Seal är en Python-modul som ger sekvensinpass på Hadoop.Seal är en av MapReduce ansökan om biologisk sekvensinpass. Den körs på Hadoop (http://hadoop.apache.org) genom Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), ett Python MapReduce och HDFS API för Hadoop. ...

avalanchetoolbox är en verktygslåda för att identifiera och beskriva förgreningsprocesser, såsom neuronala laviner Krav :. ...

Murka är en fri, plattformsoberoende och öppen källkod kommandoraden program som hjälper användarna att enkelt lösa Phylogeny problemet, helt enkelt genom att använda Median Networks. Den innehåller heuristiska metoder, exakta algoritmer, samt en Steiner...

. HTSeq är en Python ram för att bearbeta och analysera data från hög genomströmning sekvense (HTS) analyser Krav : < li>...

Orange-Bioinformatik är en orange nbsp data mining programpaket tillägg &;. Det sträcker Orange genom att tillhandahålla gemensamma funktioner för grundläggande uppgifter inom bioinformatik. Det ger också widgets för Orange Canvas, som gör det möjligt...

edittag är ett program samling för att utforma uppsättningar redigera metriska sekvenstaggar, kontroll sekvens taggar för konforma till redigerings metriska, och integrera sekvens taggar till plattformsspecifika sekvense adaptrar och PCR-primers. edittag...

VULCAN projektet ger beräkningsfluiddynamik analys.VULCAN (Viskös motvinds Algoritm för Complex flödesanalys) erbjuder Computational Fluid Dynamics för underljudshastighet genom hypersonisk turbulent reagerar och icke-reagerande flöden på en mängd olika...

seriesoftubes är en utökad pipeline för Solexa Chip-seq uppgifter.Paket Dokumentation Krav : ...

reciprocal_smallest_distance är en parvis orthology algoritm som använder global sekvensinpass och maximum likelihood evolutionära avståndet mellan sekvenser att exakt upptäcker ortologer mellan genomen. Installera från ett tarball Ladda ner och packa upp...

Bygga system som gör används ofta för att skapa komplicerade arbetsflöden, t.ex. i bioinformatik. & nbsp; snakemake syftar till att minska komplexiteten i att skapa arbetsflöden genom att tillhandahålla en ren och modern domänspecifik specifikation språk...