Bäst Bioinformatik För Linux
MetagenomeDB är en Python-bibliotek för att enkelt lagra, hämta och kommentera metagenomic sekvenser. & Nbsp; MetagenomeDB fungera som ett abstraktionslager ovanpå en MongoDB databas. Det ger ett API för att skapa och ändra och koppla två typer av objekt,...
SSuMMo är ett bibliotek med funktioner som utformats kring iterativt med hjälp hmmer att tilldela sekvenser till taxa. & Nbsp; Resultaten är mycket kommenterade träd som visade arter / genus fördelning inom denna gemenskap.Program som medföljer källkoden...
tigreBrowser är en genuttryck modell webbläsare för resultat från tigre R paket (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser kräver Python-version> = 2.5. tigreBrowser kan installeras med följande...
MACS2 är en modell som bygger analysverktyg för spån Seq uppgifter.Med förbättrad sekvenseringstekniker, kromatin immunoprecipitation följt av hög genomströmning sekvense (chip-Seq) blir populär att studera genomet hela protein-DNA-interaktioner. För att...
edittag är ett program samling för att utforma uppsättningar redigera metriska sekvenstaggar, kontroll sekvens taggar för konforma till redigerings metriska, och integrera sekvens taggar till plattformsspecifika sekvense adaptrar och PCR-primers. edittag...
MacMolPlt är ett modernt grafikprogram för att rita 3D-molekylära strukturer och normala lägen (vibrationer). Moderna...
picme är en Python-paket som innehåller program för att beräkna och rita fylogenetiskt informativeness för stora datamängder. Installation För närvarande är det enklaste sättet att installera programmet:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git...
SyntenyMiner är ett program för att visualisera och förhöra jämförelser mellan flera kompletta genomsekvenser. Gränssnittet ger en farbar syn på matcher till en referensgenomsekvens. Sekvens matcher mellan kromosomer olika genom kan undersökas vidare inom...
ProteinShop är ett interaktivt verktyg för att manipulera proteinstrukturer. Den var avsedd för att snabbt skapa en uppsättning av proteinkonfigurationer med mänsklig kunskap och intuition. Dessa konfigurationer kan utsättas för lokal eller global...
PySCeS är ett projekt som utvecklats av Triple-J-gruppen för Molecular Cell Physiology. & Nbsp; för att försöka modell och förstå de komplexa processer och system som utgör den levande cellen Funktioner :. En text baserad modell beskrivningsspråk ...
