Bäst Bioinformatik För Linux

Bygga system som gör används ofta för att skapa komplicerade arbetsflöden, t.ex. i bioinformatik. & nbsp; snakemake syftar till att minska komplexiteten i att skapa arbetsflöden genom att tillhandahålla en ren och modern domänspecifik specifikation språk...

CLC DNA Workbench skapar en programvarumiljö som gör det möjligt för användare att göra ett stort antal avancerade DNA-sekvensanalys, i kombination med smidig datahantering och utmärkta grafiska visning och output alternativ.CLC DNA Workbench finns...

seriesoftubes är en utökad pipeline för Solexa Chip-seq uppgifter.Paket Dokumentation Krav : ...

Den STEME Projektet började livet som en approximation till Förväntan-Maxime algoritm för den typ av modell som används i motiv finders såsom MEME.STEME & rsquo; s EM tillnärmning driver en storleksordning snabbare än genomförandet MEME för typiska...

Genepidgin är en svit av Python verktyg som hjälper till att utvärdering och tilldelning gen produktnamn & nbsp; Det finns tre huvudsakliga komponenter.:genepidgin * renare *& Nbsp; standardiserar gen namn per UniProt riktlinjer namngivninggenepidgin *...

MISO (Blandning av Isoformer) är en probabilistisk ram skriven i Python som kvantifierar uttrycket nivån & nbsp; av alternativt splitsade gener från RNA-Seq data och identifierar differentiellt reglerade isoformer eller exoner över prover.Genom att...

Pathomx (tidigare MetaPath) är en öppen källkod grafisk programvara implementeras i ipython, Qt och PyQt, designad från grunden för att fungera som en interaktiv verktyg för visualisering och analys av metabola uppgifter enligt GNU / Linux och andra POSIX...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) är ett effektivt program som anpassar relativt korta nukleotidsekvenser mot en lång referenssekvens som det mänskliga genomet.Programvaran implementerar två algoritmer, BWA-kort och BWA-SW. De tidigare arbeten för...

avalanchetoolbox är en verktygslåda för att identifiera och beskriva förgreningsprocesser, såsom neuronala laviner Krav :. ...

OpenElectrophy är ett ramverk för att underlätta bearbetning, lagring och analys av elektrofysiologiska data. Det kan importera data från många olika filformat och lagra dem i en enda SQL-databastypen.Analysverktyg ingår i OpenELectrophy är oscillation...