Topp Bioinformatik För Linux

AHREA är en nedladdingar svit som gör att hitta Relativ uttryck elever lätt. . Det är skrivet i Python Krav : ...

AREM är en baserad på MACS (Modellbaserad analys för Chip-Seq data).Hög kapacitet sekvensering kopplad till kromatin immun nederbörd (Chip-Seq) används ofta i att karakterisera genomet hela bindningsmönster transkriptionsfaktorer, kofaktorer, kromatin...

CWC Simulator är en C ++ genomförandet av CWC, en kalkyl för representation och simulering av biologiska system. & Nbsp; Efter en lyckad installation (se INSTALL) kommer du att kunna köra simuleringar över CWC modeller, som visas i några exempel (se...

Syntainia är en innovativ applikation för visualisering av flera genomen. & Nbsp; Den presenterar ett enkelt och intuitivt användargränssnitt för att visa och manipulera relationer mellan grupper av gener. Med en tydligare gen visualisering, är det...

checkmyclones är en programvara som ger verktyg för att kontrollera Sanger sekvense resultat. & Nbsp; (eller någon vanlig text eller FASTQ filer) mot en uppsättning referenssekvenserna, förutsatt i någon rimlig format (inklusive koordinater) Krav : ...

tigreBrowser är en genuttryck modell webbläsare för resultat från tigre R paket (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser kräver Python-version> = 2.5. tigreBrowser kan installeras med följande...

picme är en Python-paket som innehåller program för att beräkna och rita fylogenetiskt informativeness för stora datamängder. Installation För närvarande är det enklaste sättet att installera programmet:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git...

tapir är ett Python verktyg som innehåller program för att beräkna och rita fylogenetiskt informativeness för stora datamängder. Värdera tapir När du använder tapir, vänligen citera:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir möjliggör hög genomströmning...

STEG är ett paket för exakt stokastisk simulering av reaktion-diffusion system i godtyckligt komplexa 3D geometrier. Vår kärn simulering algoritm är en implementering av Gillespies SSA, utvidgas för att hantera diffusion av molekyler över elementen i en...

NEO (Neural Ensemble Objects) och är ett projekt för att ge en gemensam uppsättning basklasser som skall användas i neurala dataanalys, i syfte att få OpenElectrophy, NeuroTools och kanske andra projekt med liknande mål mer nära varandra.Två viktiga mål...