Ledig Bioinformatik För Linux

STEG är ett paket för exakt stokastisk simulering av reaktion-diffusion system i godtyckligt komplexa 3D geometrier. Vår kärn simulering algoritm är en implementering av Gillespies SSA, utvidgas för att hantera diffusion av molekyler över elementen i en...

tapir är ett Python verktyg som innehåller program för att beräkna och rita fylogenetiskt informativeness för stora datamängder. Värdera tapir När du använder tapir, vänligen citera:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir möjliggör hög genomströmning...

picme är en Python-paket som innehåller program för att beräkna och rita fylogenetiskt informativeness för stora datamängder. Installation För närvarande är det enklaste sättet att installera programmet:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git...

tigreBrowser är en genuttryck modell webbläsare för resultat från tigre R paket (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser kräver Python-version> = 2.5. tigreBrowser kan installeras med följande...

checkmyclones är en programvara som ger verktyg för att kontrollera Sanger sekvense resultat. & Nbsp; (eller någon vanlig text eller FASTQ filer) mot en uppsättning referenssekvenserna, förutsatt i någon rimlig format (inklusive koordinater) Krav : ...

Syntainia är en innovativ applikation för visualisering av flera genomen. & Nbsp; Den presenterar ett enkelt och intuitivt användargränssnitt för att visa och manipulera relationer mellan grupper av gener. Med en tydligare gen visualisering, är det...

CWC Simulator är en C ++ genomförandet av CWC, en kalkyl för representation och simulering av biologiska system. & Nbsp; Efter en lyckad installation (se INSTALL) kommer du att kunna köra simuleringar över CWC modeller, som visas i några exempel (se...

AREM är en baserad på MACS (Modellbaserad analys för Chip-Seq data).Hög kapacitet sekvensering kopplad till kromatin immun nederbörd (Chip-Seq) används ofta i att karakterisera genomet hela bindningsmönster transkriptionsfaktorer, kofaktorer, kromatin...

AHREA är en nedladdingar svit som gör att hitta Relativ uttryck elever lätt. . Det är skrivet i Python Krav : ...

E-Cell System är ett koncept för att bygga virtuella celler på datorer.E-Cell System är ett objektorienterat programpaket för modellering, simulering och analys av storskaliga komplexa system såsom biologiska celler, arkitekten av Kouichi Takahashi och...